MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli JJ1886 plasmid pJJ1886_2

Total Repeats: 99

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022649	TCTAC	2	10	16	25	20 %	40 %	0 %	40 %	556555084
2	NC_022649	T	6	6	35	40	0 %	100 %	0 %	0 %	556555084
3	NC_022649	GCGT	2	8	91	98	0 %	25 %	50 %	25 %	556555084
4	NC_022649	TGC	2	6	115	120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555084
5	NC_022649	CTTAGA	2	12	122	133	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	556555084
6	NC_022649	ACG	2	6	437	442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555084
7	NC_022649	CA	3	6	583	588	50 %	0 %	0 %	50 %	556555084
8	NC_022649	CCAG	2	8	778	785	25 %	0 %	25 %	50 %	556555084
9	NC_022649	CTG	2	6	806	811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555084
10	NC_022649	AAG	2	6	824	829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555084
11	NC_022649	ATC	2	6	869	874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555084
12	NC_022649	TCG	2	6	903	908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555084
13	NC_022649	GCG	2	6	921	926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556555084
14	NC_022649	TC	3	6	942	947	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_022649	GTTT	2	8	1020	1027	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022649	TACAC	2	10	1038	1047	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_022649	C	6	6	1113	1118	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
18	NC_022649	A	6	6	1148	1153	100 %	0 %	0 %	0 %	556555085
19	NC_022649	A	9	9	1359	1367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022649	A	6	6	1445	1450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022649	AAC	2	6	1470	1475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_022649	A	6	6	1518	1523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022649	ACA	2	6	1551	1556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_022649	GTT	2	6	1564	1569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022649	AAC	2	6	1581	1586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_022649	ATA	2	6	1606	1611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022649	AGAC	2	8	1689	1696	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_022649	A	6	6	1827	1832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022649	A	6	6	1855	1860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022649	CAA	2	6	1869	1874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_022649	CAT	2	6	1911	1916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_022649	A	7	7	1927	1933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022649	AAC	2	6	1962	1967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_022649	CA	3	6	2000	2005	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_022649	T	7	7	2056	2062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022649	CACAC	2	10	2079	2088	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
37	NC_022649	A	9	9	2098	2106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022649	ATT	2	6	2278	2283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022649	A	8	8	2294	2301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022649	ATA	2	6	2341	2346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022649	TA	3	6	2360	2365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022649	AGAACA	2	12	2371	2382	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_022649	TAA	2	6	2396	2401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022649	ATTTT	2	10	2404	2413	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022649	T	6	6	2410	2415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022649	TTCCA	2	10	2439	2448	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
47	NC_022649	AGTA	2	8	2482	2489	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022649	TTA	2	6	2498	2503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022649	ACAA	2	8	2530	2537	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_022649	T	6	6	2590	2595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022649	ATAA	2	8	2611	2618	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022649	ATA	2	6	2648	2653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022649	ATC	2	6	2662	2667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_022649	TAT	2	6	2697	2702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555083
55	NC_022649	A	6	6	2755	2760	100 %	0 %	0 %	0 %	556555083
56	NC_022649	TGA	2	6	2796	2801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555083
57	NC_022649	TA	4	8	2813	2820	50 %	50 %	0 %	0 %	556555083
58	NC_022649	CAGA	2	8	2860	2867	50 %	0 %	25 %	25 %	556555083
59	NC_022649	A	7	7	2877	2883	100 %	0 %	0 %	0 %	556555083
60	NC_022649	AAGCG	2	10	2931	2940	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_022649	CCA	2	6	2978	2983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556555086
62	NC_022649	CCG	2	6	3017	3022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556555086
63	NC_022649	CA	3	6	3072	3077	50 %	0 %	0 %	50 %	556555086
64	NC_022649	CCCA	2	8	3105	3112	25 %	0 %	0 %	75 %	556555086
65	NC_022649	GACT	2	8	3219	3226	25 %	25 %	25 %	25 %	556555086
66	NC_022649	TCT	2	6	3460	3465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556555086
67	NC_022649	TCTG	2	8	3538	3545	0 %	50 %	25 %	25 %	556555087
68	NC_022649	TC	3	6	3555	3560	0 %	50 %	0 %	50 %	556555087
69	NC_022649	CAT	2	6	3586	3591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555087
70	NC_022649	ATG	2	6	3714	3719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555087
71	NC_022649	CAT	2	6	3733	3738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555087
72	NC_022649	CGT	2	6	3780	3785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555087
73	NC_022649	TGAG	2	8	3909	3916	25 %	25 %	50 %	0 %	556555087
74	NC_022649	CAT	2	6	4009	4014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555087
75	NC_022649	TCA	2	6	4027	4032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555087
76	NC_022649	CGC	2	6	4054	4059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556555087
77	NC_022649	GCC	2	6	4233	4238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556555087
78	NC_022649	CCA	2	6	4371	4376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556555087
79	NC_022649	CGA	2	6	4439	4444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_022649	GA	3	6	4447	4452	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022649	CTTC	2	8	4467	4474	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_022649	CCG	2	6	4512	4517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_022649	AC	3	6	4546	4551	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_022649	A	7	7	4555	4561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022649	GAA	2	6	4608	4613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555088
86	NC_022649	CGGAT	2	10	4615	4624	20 %	20 %	40 %	20 %	556555088
87	NC_022649	TCA	2	6	4625	4630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555088
88	NC_022649	GACAGA	2	12	4655	4666	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	556555088
89	NC_022649	A	7	7	4742	4748	100 %	0 %	0 %	0 %	556555088
90	NC_022649	CGAA	2	8	4770	4777	50 %	0 %	25 %	25 %	556555088
91	NC_022649	A	7	7	4806	4812	100 %	0 %	0 %	0 %	556555088
92	NC_022649	ACG	2	6	4815	4820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555088
93	NC_022649	GCTAT	2	10	4896	4905	20 %	40 %	20 %	20 %	556555088
94	NC_022649	A	6	6	4906	4911	100 %	0 %	0 %	0 %	556555088
95	NC_022649	TCGC	2	8	5025	5032	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_022649	GCG	2	6	5052	5057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_022649	ACC	2	6	5064	5069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_022649	A	6	6	5121	5126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022649	CTG	2	6	5128	5133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.